微信公眾號是開發者或商家在微信公眾平臺上申請的應用賬號，微信小程序則是一種不需要下載安裝即可使用的應用，它實現了應用“觸手可及”的夢想，用戶掃一掃或搜一下即可打開應用。全面開放申請后，主體類型為企業、政府、媒體、其他組織或個人的開發者，均可申請注冊小程序。兩者之間究竟有哪些區別?
1、兩者的定位不同，微信公眾號服務于營銷與信息傳遞，微信小程序面向產品與服務。微信公眾號主要是信息的傳遞，以營銷和消息傳遞為主服務為輔，而微信小程序從功能上與公眾號有嚴格區分(不支持關注、消息推送等營銷手段)，小程序、訂閱號、服務號、企業號是并行的體系。
2、技術上的差別，微信公眾號帳號與QQ賬號互通，通過公眾號，商家可在微信平臺上實現和特定群體的文字、圖片、語音、視頻的全方位溝通、互動 。形成了一種主流的線上線下微信互動營銷方式。小程序可以借助微信聯合登錄，和開發者已有的App 后臺的用戶數據進行打通，但不會支持小程序和App 直接的跳轉。
3、兩者功能互不相同，微信公眾號功能圍繞信息展示與營銷，小程序面向產品與服務。微信公眾號分為訂閱號和服務號。
訂閱號，任何組織和個人都可以申請，每天群發一條信息，認證后有自定義菜單。沒有高級接口，不能用開發模式。選擇服務號，只面向企業或組織機構申請注冊，申請后自帶自定義菜單。認證后可以有高級接口，每周群發一條信息。均不可主動添加微信好友。
小程序對營銷功能進行了嚴格控制以與公眾號區別，使得小程序的服務在使用體驗與便捷性能夠得到提升，不至于淹沒在公眾號過度營銷信息中。微信小程序是一種不需要下載安裝即可使用的應用，它實現了應用“觸手可及”的夢想，用戶掃一掃或者搜一下即可打開應用。也體現了“用完即走”的理念，用戶不用關心是否安裝太多應用的問題。應用將無處不在，隨時可用，但又無需安裝卸載。